成为大学生的太一及亚古兽各自步上了属于自己的道路。某天，在专门研究研究数码宝贝的专家梅诺雅的告知下，太一等人得知了当被选上的孩子们逐渐长大成人之际，过去伴随著他们冒险的数码宝贝们，也将随著时间消逝，而战斗则可能会加速与他们别离的时间...就在此时，全世界被选上的孩子们周遭发生了异变，而太一等人也陷入了苦恼之中…《数码宝贝》系列20周年的纪念作品，太一与亚古兽最终的物语，就此展开！