在Gibbs失踪这两个月里，Bishop临时担任NCIS的领导。他们试图让一切保持正常，但那几乎不可能。与此同时，巴拉圭任务无论结局如何，都将对本季后续剧情产生持续影响。Delilah会在圣诞前后的新集中生下她和McGee的孩子，Ducky有机会在自己的母校致词，但他遇到了一个非常有影响力的女人，Clayton一个天大的秘密将在本季开播数集之后曝光，那是一个非常私人化的秘密。本季将出现剧烈的人事变动，CBS宣布 珍妮弗·艾斯波西多（饰演NCIS特工Alexandra Quinn）不再回归该剧，剧情安排她“辞职照顾老年痴呆症的母亲”。 玛丽亚·贝罗将从S15E04开始扮演一名犯罪心理学家。 杜安·亨利饰演的MI6情报员Clayton Reeves在剧集S15E22中被杀之后就退出了，紧接着古灵精怪的NCIS法证科学家Abby Sciuto（ 宝蕾·佩雷特饰）也要脱下白大褂，离开NCIS了。