《百万谜团》讲述的是刑侦队长赵俊峰因多年前追查“百万箱子”，导致妻儿双双死在自己面前，从此对感情失去希望，同时陷入对“百万箱子”的执念之中。多年后百万箱子突然出现，赵俊峰携刑侦队员李梅等人开启追毒行动，在此过程中，两人互生情愫。而当真相越来越近，剧情却因黑警的介入再次扑朔迷离。