这个夏天，宝可梦与人类间新的羁绊诞生了。在远离人烟的丛林深处，有一片不容任何人踏足的宝可梦们的森林。被萨戮德抚养长大的人类少年可可就生活在这座森林中。对自己是宝可梦深信不疑的可可某日在城市迷失，遇到了小智与皮卡丘，第一次有了“人类的朋友”。可可对自己的身份产生了怀疑，也正在此时，危机即将降临森林……