西暦20XX年の近未来、地球環境の大きな変化で人類は高度文明を維持しながらも、都市国家に分立して暮らしていた。高性能パワードスーツ「エンジェルブレイド」の適合者を探していた怪人集団「ダークマザー」は、とある学園を裏から買収・支配して適合者になるべく少女を見つけ出そうと目論む。