江户城隅田川东侧的深川街被称为“江户御府外地”，是一个南北町奉行所都管不到的地方。万治二年（1659年）建造两国桥，新大桥和永代桥，开挖堀川，来自各国的移民聚集起来并迅速发展成为江户的繁华地带。町奉行管辖外的恶棍大量涌入，并成为各种犯罪的巢窟，使它看起来像是“江户番外地”。有一个深川奉行所代替町奉行所管理，但是同心的人很少，他们无法消灭所有恶人。 老中稻叶越中守从陆奥国召回速水右近，速水右近被赐予“葵の御纹”将军家拜领刀，就任深川奉行。将军直接赋予他权力和使命，大刀阔斧的治理犯罪。 每集开头，深川发生抢劫，杀人事件，速水右近指挥调查，不久发现所有邪恶的根源就是在幕府担任要职的官员或是与将军家关系密切的人。深川奉行的权限无法对付这些人。顶住幕府的政治压力，奉行所的秘密调查取得进展，但还是会出现新的受害者。 在本系列的结尾，速水右近自身和深川奉行所也遭到了恶人的袭击，战斗变得更加激烈。 在最后一集（第39集）的结尾，稻叶告诉速水右近，深川的治安维持改由江户奉行所直辖，而深川奉行所将被废止。