本剧根据横山光辉的同名漫画改编。故事里，当织田信长的天下统一大业即将实现时，琵琶湖畔以南出现了一个叫《金目教》的诡异宗教。传言不信该教的人会遭到可怕诅咒。为了暗中调查《金目教》的真相，信长委派《假面忍者》前去。一名以忍者身份潜伏在暗处的青年（佐藤大树），最终变身为“假面忍者·赤影”。