由于父母离异，刚满10岁的忠志 （ 神木隆之介 饰）只好跟母亲来到乡下跟外公一起生活。一次偶然，忠志参拜神社时被选为“麒麟童子”。当地有个传说，被选为麒麟童子的孩子可在大天狗山顶拿到传说中大天狗守护的飞剑。传说那飞剑是用来维护和平的。伙伴们揶揄他不敢上大天狗山取麒麟童子的宝剑。他在尝试一半后，被吓了回来。另一方面，千年魔人加藤保宪 （ 丰川悦司 饰）复活，他利用废旧物品的怨气，将其与抓来的妖怪们扔到大怨灵炼火中融合形成邪恶的怪物军团，并率领它们企图毁灭人类。在山神、河童和川姬等妖怪的努力下，忠志通过了考验。为了保卫世界，忠志决定和妖怪们齐心合力，和大恶人决一死战，妖怪大战争正式展开 。