第一季 （1～52）： 根据传说，能收集到七颗 混沌翡翠就能获得强大的力量，邪恶天才科学家 蛋头博士企图利用这股力量统治世界，但 索尼克却总是破坏他的计划。在一次的对决中，索尼克把蛋头博士的机器弄坏了，而蛋头博士博士在混乱之下，不小心按到机器的开关，使得故障的机器启动了 混沌控制，造成时空扭曲，把索尼克与他的伙伴们送往另一个世界。在这个世界，索尼克认识了一名叫克里斯的少年，与之成为莫逆之交，也在克里斯的帮助下，索尼克找回失散的同伴。可蛋头博士仍无放弃征服世界的野心，并多次与索尼克展开死斗.......第二季（53-78）： 塔尔斯、艾咪和 可利姆在观赏流星雨时，意外认识了从外星来的少女波斯菊，同时梅达列克斯(Metarex)也开始攻击他们居住的星球，并夺走行星之卵。正当大家被梅达列克斯搞的乌烟瘴气时，克里斯竟然出现在王者翡翠前。原来他藉由王者翡翠撷取发出的能量波动来到这个世界，但因为途中出了差错，他的外表从十八岁变成十二岁，但记忆并没有流失。经过波斯菊解释后，行星之卵被夺走的星球最后都会毁灭。于是，索尼克他们展开了宇宙之旅......