距离地球相当遥远的宇宙彼端（银河系之外），屁屁星人们的宇宙船正航行着。此时，忽然有一巨大天体直冲宇宙船而来。为了避免巨大陨石对宇宙船造成影响，屁屁船长下令发射大量圆盘型的特殊炸弹，最后，顺利引爆陨石解除了当前危机。然而，就在陨石爆炸瞬间，一枚未爆弹就这样脱离了陨石碎片，并一路向地球的日本冲绳飞去。野原一家五口，因为广志于公司服勤达15年，便特休来到 冲绳度假。小新和小白在海滩玩的时候，意外地发现了一个不可思议的圆盘。小新将神秘圆盘拿来像飞盘一样抛掷，飞行过程中圆盘忽然被启动，并瞄准了小新的屁股。察觉小新有危险的小白见状，舍身撞倒了小新，不过这个神秘圆盘却像个尿布般，紧紧附著在了小白的屁股上。实际上，神秘圆盘的本体就是由屁屁星人所开发的特殊炸弹。而它的存在也引起了国际宇宙监控站（Unidentified Nature Team Inspection，UNTI）简称方便站的注意，为了回收这枚炸弹，开始密切收集野原一家的讯息。几天后，方便站队员前往冲绳追踪即将搭机返回春日部的野原一家，殊不知，在机场竟然遇上了同样盯上屁屁炸弹的美女恐怖集团零胡须歌剧团，妨碍了方便站队员的回收任务。零胡须歌剧团团长．宝种打算和小新以物易物换取小白，最后小新一家下了交流道，交涉失败。在高速公路上遇上麻烦事，几经波折的野原一家回到了春日部，没想到方便站长官．时雨院时常和数名队员已在家中守候，并向他们解释有关小白屁屁上的炸弹，一旦爆炸其威力足以摧毁地球的状况。方便站的技术无法将炸弹从小白身上拆卸，时雨院因此启动第二计画火箭计画，让小白搭乘火箭飞向宇宙，使炸弹于宇宙引爆，届时以小白的光荣牺牲换来地球的和平。然而，这项艰难却又非做不可的决定让广志和美冴心烦意乱，不过，小新却是坚决地回绝这个请求，并带著小白逃了出去。究竟，65亿8462万1764人的性命和小白，小新到底该如何取舍呢？还有野原一家要如何同时面对方便站与零胡须歌剧团两方人马的逼近。