在第一部《 少年包青天》中屡破奇案的包拯已展示了他绝顶的聪明机智，这让一直拿他比较的 公孙策最终拜服，甘愿辅佐他办案。他们带着持剑卫道的侠士展昭再次收到皇上的密令出动，沿路在各个案件里遇见 王朝、 马汉、 张龙、 赵虎及惯偷 小蜻蜓。包拯在审理一系列错综复杂的案件渐渐褪去了 初生牛犊不怕虎的生涩和冲动，成了稳重而有担待的县城父母官，不重名利，只愿偏安一隅为民请命。该剧由《英雄本色》《义薄云天》《藏龙卧虎》《偷天换日》《石破天惊》《天罗地网》共六单元组成。话说横陇决堤，却牵出一宗贪污弊案，仁宗遂寻回昔日之好帮手包拯，希望能找出贪污案幕后元凶。但此案牵涉到极高层，且真凶十分狡猾，令包拯陷入重重危机，而案中主要证人，又在重要关头被人在密室下毒杀死，令案件更加扑朔迷离。而公孙策又因为患了怪病，快将失明，令包拯失去援手，陷入困境。王朝、马汉身陷冤狱，包拯路见不平，拔刀相助，终令二人沉冤得雪，马汉母亲非常感激包拯，当“父母官”的念头科于在包拯脑中浮现，仁宗推波助澜，终赐包拯知县一职，但就在这时，一宗十年前的七尸八命案的逃犯却被人发现，包拯遂接下这十年前的命案上任，岂料此案中所有重要证人陈大在房间中失踪，张根在湖面消失，王田在破庙被人抓走又借尸来假冒。虽然所有证据皆证明逃犯确是真凶，且证人的失踪亦似乎是他所为。但包拯却抽丝剥茧，却发现竟然案中有案，终令十年前那命案的重重谜团得以解开。展昭无意间得悉有人要在金龙寺行刺包拯，但因为包拯接了皇上密旨，一时间行踪不明，公孙策遂决定先行混入金龙寺，希望能在包拯抵达金龙寺之前找到刺客。岂料金龙寺内竟然藏龙卧虎，展昭突然在密室中毒，而寺内双相继发生离奇事件，令公孙策陷入迷雾之中，就在包拯将抵金龙寺之时，不仅刺客仍未找到，还遭刺害。小蜻蜓与包拯一直可算是对斗气冤家，但当小蜻蜓突然有一天竟然冒充是大画家冯止水的女儿后，一向以来活泼的小蜻蜓竟然变得十分奇怪。包拯知道小蜻蜓一定有些不可告人之秘密，所以决定也混入冯府，原来小蜻蜓一直在寻找其义父之下落，但其义父究竟与冯止水有何关联，就在包拯甚感好奇之际，却发现冯府地牢竟然藏有一副骸骨。冯府内可谓充满诡异，冯府曾经发生过骇人听闻的事将被揭晓。展昭打算回相国寺去，途中竟然遇上一名叫“芳芳”的小孩子，芳芳一家原来在途中遇害，家人及家仆都被杀害，展昭路见不平，决定替其打官司。当衙役接办此案之后，却发现芳芳竟然是大话连篇，气得展昭弃下芳芳，但就在这时，展昭却发现有人暗中将所有重要证据消灭，令人误会芳芳说谎，展昭猛然惊醒，并在千钧一发之际救出芳芳，及后却发现芳芳的身世十分扑逆迷离，最终在包拯的帮助之下，查出芳芳那惊人的秘密。