在病毒危机结束后两年，受其影响的藤丸 （ 三浦春马 饰）决定再也不碰电脑，可是他还是不能阻止自己和朋友九条音弥 （ 佐藤健 饰）、高木遥 （ 川岛海荷 饰）被卷入到新的计划当中。载有核弹的飞机正在一点点向东京逼近，而东京的群众却毫不知情，为了避免东京遭受到核弹的重创，藤丸和音弥不得不继续开始奋战。而他们所面对的除了老对手折原玛雅 （ 吉濑美智子 饰）和神崎润 （ 成宫宽贵 饰）外，还有许多新人 。