我们正身处一个恐慌年代，在恐怖组织的威胁下，无人能够独善其身。为求捍卫社会安宁，ATF反恐团队以强硬手段对付恐怖分子，面对一次又一次的恐怖袭击，绝不容忍妥协。日本特种部队SAT（Special Assault Team）传来线报，指国际龙舟赛成为了恐怖分子的袭击目标，ATF严阵以待。背负着警方卧底身份的古惑仔庄有正 （ 陈展鹏 饰），奉黑帮之命，前往赛事场地放置计时炸弹，却被身为SDU成员的弟弟庄有杰 （ 吴卓羲 饰）发现，穷追不舍。追捕期间，有杰意外落入恐怖分子手中，幸好有正及时迎救，兄弟携手，配合ATF精妙布局，终成功拘捕恐怖分子，化解危机。两兄弟为警队立下大功，随即申请加入反恐部队。受训期间，有正表现出勇猛果敢，当机立断性格，为求协助同伴，不惜违规受罚；有杰则着重团队精神，严格遵从长官命令，全力执行获委派的任务。尽管两兄弟性格迥然，但二人合作无间与出色表现，得到上司肯定。受训完毕，有正和有杰分别被派往调查组和行动组，跟随情报组总指挥沈志敖 （ 关礼杰 饰）及行动组总指挥高威 （ 黄德斌 饰）进行反恐工作。无独有偶，二人亦同时对ATF情报分析员钟日嘉 （ 陈茵媺 饰）暗生情愫，分别对她展开追求。ATF收到马来西亚警方UTK部队（Unit Tindakan Khas），以及美国国土安全部（US DHS-U.S. Department of Homeland Security）的情报，得悉犯罪组织会将一批军火运往香港，但ATF只搜获其中一部份，并怀疑其他失踪军火将被用于在港举行的世贸会议。专题记者叶婷 （ 蒙嘉慧 饰）曾经报导ATF的反恐训练，因而认识有正。叶婷意外得知被窃军火与恐怖组织“惊鸟”有关，暗中把情报交给有正，协助破案，二人因而建立出一段微妙关系。ATF在追查之下，发现“惊鸟”不但与军火失窃案有关，还正策划另一宗更加骇人的毒气弹恐怖袭击。为 “惊鸟”制作毒气弹的科学家王教授 （ 李成昌 饰）中途叛变，并要求ATF提供保护。有正负责护送王教授前往安全屋，但藏身地点外泄，“惊鸟”派人袭击，有正虽然成功安排支援队员救走王教授，自己却被捉拿。“惊鸟”要胁以有正交换王教授，ATF拒绝，“惊鸟”一怒之下射杀有正，并透过电脑网络将行刑片段传送至ATF作为报复。