《伊甸园之东》跨度长达40年，起于上世纪的60年代，收场于21世纪初。1960年，学生运动的积极分子李基哲听到爱人的哥哥因自己而失去性命的消息后，在自责和矛盾下来到江原道一个偏僻的探矿。在那里李基哲为了阻止太白煤矿老板申泰焕的恶行，组织劳动工会与之对抗，不幸遭到申泰焕的毒手。亲眼目睹父亲死亡的李基哲的大儿子李东哲( 宋承宪饰)发誓要为父亲报仇。被申泰焕蹂躏的太白医院的护士美爱为了报仇把申泰焕新出生的孩子和李基哲的孩子调换，两个男人的开始了各自不同的命运。明勋从小从东哲那里听到基哲的故事，对自己的亲生父亲申泰焕恨之入骨，长大后以第一名的成绩考入首尔大学法律系。而被调换来到申家的东旭从小接受财团继承人的培训，东哲则远赴香港成为赌场里呼风唤雨的人物。