故事回溯到五百年前的大明朝，繁华的京师之内，人来人往、熙熙攘攘，尽显盛世之象。京城的一角，有一家名为天和医馆的医馆，馆主陈幕禅（杨皓宇 饰）凭借专治疑难杂症的医术闻名京城，鲜为人知的是，他实则是西厂的特务。某一日，陈幕禅离奇失踪，立志成为御医的学徒朱一品（陈赫 饰）意外得到了一个至关重要的卷轴。大小姐陈安安因家庭变故悲痛万分，而卷轴的出现，将朱一品、其师兄弟赵布祝（佟磊 饰）以及陈安安一同卷入了一场前所未有的风波。东厂高手杨宇轩（王传君 饰）和西厂高手柳若馨（姜妍 饰）先后潜入天和医馆，两人在勾心斗角之中，也上演了一段段纠缠不清的儿女情长。