国民党为对大陆各地做最后抵抗，筹集了一批黄金计划由香港晏先生旗下远东航运公司的轮船“大丰号”送往国军总部，而负责押运这批黄金的人便是我党地下情报员黄以轩的父亲，在黄以轩的劝说下，黄父决定在押运这批黄金的途中领船投奔共产党，却在实施计划的时候被 国民党特务孙世安识破，报告给了国民党情报机构，使得黄以轩的一家老小死于国军手下，黄父也在激战中被黄以轩误杀。黄以轩与孙世安就此结下深仇。国民党情报机构安放定时炸弹，造成“克什米尔公主号”空难。我国政府派出特使前往案发地，调查事件真相。与此同时，已经在总部反间谍局任处长的黄以轩被派往案发地，通过那里的反间谍网络追查真凶。而作为国民党情报机构的高级特工，孙世安也在此时接受了掩盖事件真相，并安排善后工作的任务。黄以轩恰巧落脚在“大丰号”的东家——晏先生家，对“克什米尔公主号”的惨案，晏先生爱憎分明，对黄以轩的任务晏先生也十分支持。一次，黄以轩尾随并制服了孙世安，让其坦白杀死刘茵和黄以然的全部真相，但孙世安坚称与自己无关，且黄以轩的女儿没有死，只是下落不明。在我国官方掌握了大量证据，迫使港英当局对“克什米尔公主号”事件的调查逐步接近真相的同时，黄以轩获得的情报则进一步将庞大的国民党特务网络暴露出来，这让在香港的国民党情报资源受到越来越大的威胁，让孙世安所谓的善后工作难以“善后”。“克什米尔公主号”事件的结局，是港英当局迫于我方压力，将大批国民党特务驱逐出香港。孙世安虽不在驱逐名单之列，但也只好同期撤离香港。黄以轩完成任务后也返回大陆。黄以轩回到了北京总部。他在香港的工作受到肯定和表扬，而在执行任务是的一些处理方式却遭到了某种质疑。晏先生的女儿通过高层特别批示，与黄以轩结婚，被安排到了外交部工作。黄以轩从总部接受命令，保护一个重要人物回国。此时，黄以轩收到一封孙世安通过晏先生转来的信件，信中为寻找女儿提供了新的线索。孙世安从黄以轩丢失的笔记本中得知黄以轩的任务，他认定重要人物会搭乘晏先生公司的“阿格尼丝号”货轮。孙世安为此找到晏先生，要求晏先生一定不能插手此事。黄以轩利用国民党特务机构采取下作手段胁迫孙世安女友入伙，企图策反孙世安。孙世安虽然同样对上司的卑鄙忿忿难平，结论却是即便如此也不能对不起“两蒋”的多年赏识和栽培。孙世安判断失误，重要人物安全归国。黄以轩完成任务返回大陆。不久之后，孙世安派人以香港记者的身份前往北京，通过黄以轩和晏思扬接近在一家从事铀浓缩的秘密工厂工作的张国民。黄以轩和总部都认为，来人是要完成国民党方面没能完成的暗杀。他们的错误判断，使来人通过张国民得到铀浓缩工厂的相关数据。黄以轩被调回北京为总部的训练班授课。在训练班中一女学员的相貌与儿时经历都与自己女儿十分相似，当黄以轩将这个女学员的情况告诉妻子的时候，妻子将自己已经掌握的情况和盘托出，他们高兴地得出结论，这个女学员就是黄以轩失踪多年的女儿。