公元2099年， 地球环境已濒临毁灭的边缘，人类不得不把地球上的污染源全部转移到一颗叫B25号的小行星上。数年后，B25产生了一股黑暗势力——煞星军团。他们妄图在地球上找到传说中的能量水晶，从而占领地球，并摧毁地球上的一切生物。四个孩子偶然发现了神秘的晶码机和晶码兽，并被赋予了拯救地球的重大使命。他们凭借与晶码兽的默契和信任，挫败了煞星军团的阴谋。然而新的危机再次来临。野心勃勃的魔煞王，找到了不甘心失败的煞星。他们联合起来，试图夺取宇宙。宇宙中最纯净美丽的S星将要“光临”地球上空，人们激动地等待着，却不知魔煞王要利用这百年难遇的机会一举摧毁地球。晶码战士临危受命，再次踏上旅途，赶往正被魔煞王污染控制的S小行星，与超级晶码战士联手，找到隐藏的恶污之塔，阻止他们的阴谋……性格：自信，开朗，比较冲动，超级自恋，喜欢打抱不平。背景：龙炎的爸爸在龙炎小时候就离开了。龙炎记住了父亲的嘱托，认真的研究着父亲所留下来的一切，直到有一天，煞星派来了四只魔兽对地球进行破坏……于是，龙炎义无反顾地和小伙伴们踏上了旅程。性格： 冷静冷酷，头脑清醒，外表冷酷实际上是内心孤独。背景：因为想尽可能的消灭一切魔兽，于是和大家一起迈上征途。虽然刚开始不善于接近同伴，还经常与龙炎吵嘴，但后来因为当自己遇到危险的时候，龙炎他们总是义无反顾的帮助他保护他而感动，还有晶码兽对自己的鼓励，让自己感到了友谊的力量。身份：超生物兴趣研究小组成员。科学家的儿子，父亲不明，妈妈后来又失踪，一直一个人生活，并在不断寻找。事实上与是科学家妈妈关系不好，主要是因为妈妈对超能力兽的爱超越了对他的爱，尤其是 狸面蛇魔兽，但又成为朋友，后因战斗而对其失望。