一名警探在波士顿地铁主干线内离奇遇害，尸体惨不忍睹，地铁被迫停运。斯科莉（Gillian Anderson 吉莲•安德森 饰）和道吉特（Robert Patrick 罗伯特•帕特里克 饰）接受此案，却被地铁交通负责人卡拉斯（Ken Jenkins 肯•杰金斯 饰）限令5小时内破案。 斯科莉留守总部，道吉特则和相关人员走进停运的隧道，寻找个中原因。众人在已废弃的岔道找到曾谋害警探的男人（Bill Jacobson 饰），但该男子已死，死因和警探相似。不久调查人员们相继出现感染症状，身体上浮现绿色荧光，皮肤剧烈灼烧，而这一切的诱因还不得知……