涅吉雷吉亚的西奈拉博士因为自己的“强化人类”实验失败而被世人指责为杀人的科学家（死去的是他的女儿），便认为人类是脆弱的，于是向地球进行破坏行动，想要将全人类改造成符合自己想法的样子。久保田博士令健太、耕一郎、瞬、千里和美久变身成百万连者，进行对抗涅吉雷吉亚的行动。后期更出现了第六位战士早川裕作，起初新战士不太喜欢MEGA连者，后来相处日子越多，感情越深厚。西涅拉博士最后甚至控制了贾米乌斯一世，并且舍弃自己的生命想要与电磁战队一起毁灭。这一次的作品是继1989年的 高速战队涡轮连者，再一次由高中生出兵，意味着青春灵魂永不熄灭。不同的是，涡轮连者他们没拍 毕业照也没拿毕业证书。本作首次出现银色战士，也是首支出现追加的银色战士成员。本作首次以黑色战士设定为最年长的初期成员。本作继《 超力战队王连者》以来连续三次出现女性黄色战士初期成员，同时这也是1990年代中的第四位女性黄色战士。他是一位 世界科学联盟I.N.E.T的最高领导人，也是百万连者的司令官，平时对 未来科学包括扭曲空间等深入研究，此人态度严谨也很和蔼，是个高学历的科学家，他包办了百万连者一切的事务，包括制造数码武装环、创造百万宇宙战舰等等。久保田博士的助手，专门给予健太他们使用数码武装环，他也是数码武装环的 技术科学助理。他是川崎博士的儿子，也是I.N.E.T首席机械技师，他主要负责的是维护和修理百万机械，他对技工的热情可说是十分真诚的，他不顾父亲的反对，终于还是选择成为I.N.E.T的成员，在对抗邪电王国战役中，他独自驾驶银河Mega，在对战时不慎被破坏，受到严重的损伤，可将损伤的机体送往月面基地担任检修的工作。来自异次元的扭曲空间支配者，策划了征服 三次元世界的的阴谋，并开始了他们的侵占行动。圆盤状的要塞迪斯涅吉洛是前线基地，扭曲兽和古力古力士兵都从要塞送往地球。在希磊拉博士的领导下，带领两名强大邪电战士与众多邪电兵团，企图征服地球，是一群存活在扭曲空间的邪恶组织。