江南省美丽的海滨城市。当地的经济一度发展很快，但是同时，一些不法分子也在改革的大潮中浑水摸鱼。他们开办虚假的空壳公司，利用国家出口退税政策上的漏洞，大肆进行虚开增值税专用发票，骗取国家出口退税的犯罪活动。针对日益猖獗的涉税犯罪，在国家税务总局的指导下，江南省国家税务局迅速成立了以副局长邝亚北为组长、稽查局长常泳波为副组长的专案组，组织全省精锐力量进驻江南，对当地偷、骗税犯罪活动进行重点打击，行动代号“利剑”。专案组的到来，使一些犯罪分子如惊弓之鸟，尤其是一个个虚假企业的犯罪手段被拆穿后，真正的幕后老板逐步浮出水面。一个以外商身份积极活动在当地的号称“马哥”的人露出了马脚，犯罪身份暴露后，他不但杀人灭口，还利用远东公司的庇护，将虚假企业账册资料藏匿到远东公司，利用被拉下水的东界县国税局副局长孙朗的关系，从税务局票库中调包发票进行虚开，在逃亡出境的时刻，公安人员宣读了对他的逮捕令。稽查局长常泳波是远东公司总裁肖学农当下乡知青时的遗腹子，由于母亲拉扯他含辛茹苦，所以他对母亲言听计从，甚至放弃两情相悦的爱情。后来他的同窗女友嫁入豪门，成为远东公司总裁肖学农的儿媳。作为为省人大代表的肖学农，在国外继承一笔遗产后，回到了曾经熟悉的地方，但是他从当地人们口中得知，常泳波母子已背井离乡。常泳波的母亲常舒然知道肖学农回到了江南投资，为了不打破生活的平衡，她始终关注着远东公司的发展。但是后来知道肖学农卷进了骗税案件，而主持查证的正是他们的儿子常永波。严厉的查处几乎使远东公司破产，失去理智的肖家公子肖峰在“马哥”的挑唆下，想采取极端的手段报复，杀掉常泳波，情急之下，常泳波母亲常舒然找到肖学农，阻止了这对“肖家兄弟”的同室操戈。江南的涉税案件查清了，税务稽查干部饱受辛酸，甚至付出生命的代价，税务稽查干部还没有来得及庆功，新的战斗又打响了，专案组成员又投入“利剑二号”行动 。