主角Michael Scofield的兄弟Lincoln Burrows被以谋杀罪处以死刑，但Michael坚信他是被冤枉的。为了拯救自己的手足，Michael抢劫了一家银行，因此而被与Lincoln关进福克斯河州立监狱。作为一名建筑工程师，他了解监狱的建设蓝图。年长的犯人改造官Bellick教会了Michael很多监狱的生存之道。在狱友Sucre的帮助下，Michael开始与其他帮派广泛结盟。越狱在第一季结束的时候，最后一幕温特沃斯·米勒饰演的迈克尔·斯科菲尔德与几名狱友历漫长的令人喘不过气脱狱，逃出例如福克斯（FOX）监狱的封锁。在第二季中，八个逃出生天的一级重犯成为全国警力追捕的对象在逃亡过程面临着种种情况，故事接着发展。而且因为林肯被陷害与一宗政府阴谋有关，所以从第二季一开始，迈克尔·斯科菲尔德兄弟俩着重进行调查，希望能揭开阴谋背后的黑暗真相。而成功逃离监狱的5名狱友分别在美国中部逃窜，其中会有重新被捕的，也会有死于逃窜途中的。