小学生の落合賢太の住む町で殺人事件が起きる。川辺でバラバラ死体が見つかり、賢太は事件現場で川を泳ぐワニを見てしまう。クラスでワニの話をして、みんなにバカにされた賢太は仲間を集め、ワニを捕まえようとする。事件はワニの仕業か、犯人の仕業か。先生や親、対岸でトランペットの練習をする女子高生を巻き込み、あらゆる対立は死体の見つかった川へ引き寄せられていく。