夏日里北京的早晨，一辆班车开到幼儿园门口，孩子们蹦蹦跳跳进屋吃早餐。可是，一位四岁小女孩辰辰却拒绝进屋，坚持在门口站着，她已经等了两个星期。一个小时后，一位四岁男孩南德来了，他就是辰辰等待的好朋友。他们一起游戏，吃饭，午睡也在一起。起床时，南德还细心地为辰辰系上裙带。辰辰天天来得早，南德天天来得晚，等待成为辰辰每天早晨的功课。正在这时，一群愤怒的家长冲进办公室，要求大李老师开除一位五岁男孩池亦洋。池亦洋身材高大，强健有力，连续抢了栋栋的棍子、打哭佳佳，惹起公愤。大李老师请求家长们给他一段时间改造池亦洋。初秋的早晨，辰辰感冒了，却依然坚持在门口等待南德。最近老师和小朋友的鞋子总是莫名其妙地丢失。偶然中摄影机拍摄到一位小男孩吃力地把足球扔进比他还高的垃圾桶，然后是鞋子和小玩具。这位小朋友是刚刚两岁、还穿着尿不湿的锡坤。秋季足球赛鸣哨开战，守门员池亦洋连续丢了三个球，急得用手拦球，大李老师判他犯规。池亦洋不服裁判，与大李发生冲突，还破口骂人，被请到反思角。不久，因为他扬言要掐死佳佳，又连续被请进反思角。几番冲突，小朋友离他而去，池亦洋成了孤家寡人。深秋的北京，树叶金黄，辰辰依然天天在冷风中等待南德。锡坤的兴趣从室外转移到室内，他悄悄溜进储物间，把小朋友的零食打开一一品尝，还在中午走进教室，把珠子撒了一地。这时，室外爆发冲突，池亦洋挺身而出，迅速而公正地解决了佳佳和栋栋的矛盾，带领一群小男孩进行军事训练，升国旗，唱国歌，俨然一位小将军。雪花飘飘的早晨，辰辰像往常一样在门口等待南德，她并不知道她在等待一个坏消息。这一天堵车严重，等待格外漫长。大李老师也陪同辰辰站在雪中，她知道这是辰辰最后一次等待，在家长的坚持下辰辰和南德将分去不同的幼儿园。等待40多分钟后，南德终于来了，大李老师不得不告诉他们分开的消息。这是2009年第一场雪，孩子们去原野上疯跑、喧闹、打雪仗，惟独不见辰辰的身影 。巴学园是日本图书《窗边的小豆豆》里的一所学校，是一个儿童的理想国。张同道听说儿童教育家李跃儿用巴学园来命名自己的幼儿园，试图把巴学园从理想搬进现实生活里的中国社会，他不禁对此产生兴趣。张同道去巴学园参观了几次，每一次都发现一些新鲜事。当他看了法国纪录片《是与有》和中国纪录片《 幼儿园》等作品后，也萌发了自己拍一部纪录片的想法，借此来探索孩子的内心世界，于是便有了纪录片《小人国》 。该片于2006年夏天开拍，拍摄周期长达3年时间 。