那个国家栖息着龙——神话中说，古时的人与龙定下了契约，龙帮助人，人帮助龙……舞台是“龙之国”。主人公是为国之守护神“龙”清理蛀牙菌的新手牙医——野野子。与邻国的战争日趋激烈，某天她在龙的牙上发现了昏倒的敌国少年兵。少年的名字是贝尔。他在被称作巨大灾难前会出现的不可思议现象中，于巨大的牙齿中复活了。贝尔对自己的处境感到疑惑。为了鼓励他，野野子将他接纳为龙的牙医。被卷入了激烈的战争，两人不久将去接受自己的命运……龙是人类在地面上出现的遥远的从前在此处栖息的。不停地在天空中飞翔，没有人见过其在地面上的身姿。特征是巨大的口中并排的三排牙齿，这牙齿正是龙力量的源泉，也是其唯一的弱点。在龙的国家遭遇危险之时，龙会为了保护那个国家而使用力量。这是遥远的从前龙与人缔结的契约。从龙的牙齿中会出现被称为蛀牙菌的奇怪生物，侵蚀削弱龙的牙齿。驱除这种代代产生的蛀牙菌，保护着龙的牙齿的，就是“龙的牙医”。为了成为龙的牙医需要特别的考试，不过通过者极为稀少。龙的牙医们居住于在龙的下颚建造的宿舍中，和龙一起生活着。宿舍里除了治疗牙齿的必要工具外，床铺、食堂、浴室等生活设施一应俱全。因此他们几乎不会降落到地面上。龙的背上是与龙通信的神官们的公司，以及国防依靠龙的力量的军人们的军营。龙的牙医们会用一些特殊的道具，但其中有代表性的是被称作“龙爪”的工作棒。用龙的指甲和皮肤制作的东西，对攻击寄生于龙的力量中的蛀牙菌有效。龙爪可改变形状，对抓住不规则运动的蛀牙菌有帮助。但是，这是龙的力量的一部分，离开龙就会失去该力量。蛀牙菌们不是生物，而是荒魂，近于魑魅魍魉的存在。在天灾或战争的情况下数量会增加，由此被指出与人类灵魂的关系性。除在牙齿上出现这一共通点外，也确认了大大小小各种各样的蛀牙菌。只能在特殊条件下被观测到的也有很多，这暗示今后可能会出现未知的菌。