该动画电影承接《变形金刚：大电影》，主要交代五面怪的来历。该片本来和大电影一样，作为TF系列的动画电影来发行。后来，该片被剪辑修改成五集的动画剧集，编入变形金刚第三季中。 故事衔接《变形金刚：大电影》，时间背景为2006年，汽车人击败了宇宙大帝，同时，以 惊破天为首的霸天虎败退。正当汽车人在庆贺他们取得大战的时候，他们受到了神秘 的邪恶力量的攻击。得知霸天虎不是进来连串攻击时间的主谋后，汽车人决心要找出个究竟来，他们查出幕后主谋是五面怪。咨询国母体电脑以后，补天士 得出了一个惊人的结论，这很可能士所有变形金刚的末日。在邪恶的五面怪几乎要被汽车人毁掉的时候，他和霸天虎组成了一个黑暗联盟。这回，汽车人被困在他们的两个死敌之间了。补天士发现了五面怪的真是性质，这是个惊人的发现。但是这已经太迟了，因为霸天虎正在攻击地球和塞伯坦。大战在蔓延，罗嗦和转轮必须完成一个艰巨的任务，否则地球就会陷落。另一方面，汽车人必须阻止狂暴的霸天虎，否则塞伯坦就会落入到五面怪的手中。最后，汽车人取得的胜利。