剧情接续前作《变形金刚:组合战争》，红蜘蛛的身体被众变形金刚摧毁，而其灵魂则飘荡在赛博坦上空，寻求复仇，而一股神秘的力量将红蜘蛛塞进了泰坦金刚铁甲龙的身体。铁甲龙暴走逼近了汽车人城，猛大帅与密使联手对抗铁甲龙但不敌，猛大帅被杀死。而与此同时，在后方指挥战斗的议会领袖祝融夫人被闯进的霸王杀死。铁甲龙吞噬了密使，增强了力量，而风刃和因为交出领导模块而从补天士退化的热破联手救出了密使。可重伤的热破被霸王劫走。此时，众组合金刚找到了另一个沉睡的泰坦金刚巨无霸福特的位置。无法坐视战斗不管的众组合金刚通过组合秘宝的力量变成了泰坦状态前往战斗，而风刃则和密使设法唤醒了巨无霸福特。感受到威胁的擎天柱将领导模块交予了科学家感知连糠垫器，自己则前往前线战斗，但力量仍不敌铁甲龙，正当危急时，巨无霸福特赶到，压制了铁甲龙。然而不巧铁甲龙吞噬了携带组合秘宝的凯旋女神，再次压制巨无霸福特。最终，赶到的感知器将领导模块故意给铁甲龙吞噬，将红蜘蛛的灵魂逼出，化解了危机。可此时突然出现的震天尊夺走了领导模块和组合秘宝，并杀死了擎天柱，新的阴谋正在浮出水面……