“在不同的次元，你可以遇见和自己长相相像、拥有相同灵魂，却完全不同的人……”在这全新架构的世界观下,《翼·年代记》可以说是CLAMP漫画人物的超空间舞台──这套除了小樱及小狼外，还有六个原创人物主角：法伊、黑钢、壹原侑子、四月一日君寻、百目鬼静、九轩葵。（侑子、四月一日、百目鬼、葵被分类至《四月一日灵异事件簿》中，更凸显本作平行世界并行的故事观。在翼中百目鬼、葵并未登场）故事讲小樱及小狼来自玖楼国（在日文中，《CardCaptor樱》的大魔术师“库洛”与“玖楼”是同音），因为一次未知原因的意外．令小樱的记忆羽毛四散至不同的空间，而法伊及黑钢亦为了不同理由（其实全部都是飞王的阴谋，可以在看完全部动画后看东京默示录就明白了，不过只是一部分，法伊的故事在后面的色雷斯国故事中会讲明），与小樱及小狼共同进行穿梭在不同异世界去寻找小樱的羽毛的旅程.。在神幻、热血、疑异的动漫界，这么一部十分温馨美好的动漫实在是不可多得，它告诉人们什么是责任和为了必须要做的事所付出的代价与努力。小狼是玖楼国的考古学家和小樱公主从小便是青梅竹马。多年后，经过考古的挖掘，遗迹渐渐露出，小樱本打算向小狼表白爱意，当天晚上飞王控制小樱前往遗迹，遗迹因拥有无穷力量的小樱的到来突然发生异样，催动了小樱身上力量的苏醒，使小樱身上长出记忆之翅，在遗迹中隐没，小狼冲上去抱住小樱，但由于小狼的打断，翅膀上的羽毛却一根根飞散，接着她便昏迷不醒。祭司雪兔得知小樱的“羽毛”已飞散到各式各样的异世界去，那些羽毛是公主的记忆，若不赶快找回部份羽毛，小樱将会有生命危险。由于情势危急，雪兔遂私自决定把两人送到身在不同的次元世界的“异次元的魔女”侑子。在日本国，负责保护知世公主的忍者黑钢因经常杀死入侵者和敌人。知世公主为了让他了解犟劲的真正意义，在他身上施咒，不准他再杀戮（咒的内容大概：如果黑钢随意杀生的话，强劲就会减少一点。）；又把他送往异世界“异次元的魔女”处，希望他在旅程中学习。另一边，在色雷斯国，法伊为逃离阿修罗王的追捕，以魔力把自己送到“异次元的魔女”身边。四人都抵达了“异次元的魔女”侑子面前，她能实现任何人的愿望，只要付出相对的代价，就能够实现愿望。小狼带着小樱与新结识的法伊和黑钢踏上了在不同次元甚至不同时间寻找羽毛的征程，而飞王也在密切关注着事情的进展。只是主人公四人不会想到，这一切的一切，都是一个巨大的阴谋……